生物化学 PCR(聚合酶链式反应)引物 制造(固相磷酰胺化学法) 购买 存储
引物(Primer)
- 引物(Primer)是一小段单链 DNA(通常 18~25 个碱基),与模板 DNA 的特定位点互补。包括:Forward Primer(正向引物)和 Reverse Primer(反向引物)。PCR工程中可为 DNA 聚合酶提供“启动点”,定义了 PCR 扩增产物的两端,控制扩增区域的长度和特异性。
特性 | 内容 |
---|---|
类型 | 单链 DNA(通常为 18–30 个碱基) |
序列来源 | 根据目标基因序列,在软件或数据库中人工设计 |
功能 | 提供起始位点,与模板 DNA 上特定区域互补,用于启动 DNA 聚合酶复制 |
合成方法 | 固相磷酸三酯法(Phosphoramidite 化学合成) |
pcr引物制造
- PCR 引物(Primer)是实验中用于“起始 DNA 合成”的短链 DNA 分子。制造引物的过程本质上是化学合成寡核苷酸。PCR 引物由专门的核酸合成仪器制造,大致过程如下:
步骤 1:设计引物序列(人工)
你先根据目的基因,在电脑上设计出需要的 5’ → 3’ 的 DNA 序列,比如:
Forward:5’-AGTGGGGGGACATCAAGCAGCCATGCAAA-3’
Reverse:5’-TGCTATGTCACTTCCCCTTGGTTCTCT-3’
步骤 2:用“磷酰胺法”合成 DNA
- 从 3’ 端 → 5’ 端一碱基一碱基地拼出来的,每轮合成只加一个碱基,重复进行 N 轮(N = 引物长度):
步骤 | 说明 |
---|---|
① 固相支持物 | 通常用硅珠或树脂,固定第一个碱基的 3’ 端 |
② 活化 | 添加下一个磷酰胺单体(例如保护好的 dA、dT、dC、dG) |
③ 缩合 | 用催化剂让新碱基接到前一碱基的 5’ 位上形成磷酸二酯键 |
④ 氧化 | 将磷三酯氧化成稳定的磷酸结构 |
⑤ 脱保护 & 洗脱 | 去除保护基团,从固相物中释放下来,得到引物 |
步骤 3:合成后纯化
- 为了得到高纯度引物,一般以下方法:
方法 | 说明 | 应用范围 |
---|---|---|
脱盐 | 最基础,用于普通 PCR、成本低 | 实验室常规用途(如 HIV 检测) |
PAGE | 聚丙烯酰胺凝胶纯化,高分辨率 | 用于高精度分子克隆 |
HPLC | 高效液相色谱纯化,杂质少 | qPCR / 探针 / 高保真扩增 |
购买引物
- 从寡核苷酸合成公司定制购买:
在线下单:输入序列、长度、纯化方式、规模(nmol 或 OD),约 1–3 天(和纯化方法有关)的合成周期,样品多以冻干形式寄出,实验室溶解使用(TE buffer 或无酶水)。
平台主页 | 平台名称 | 官网链接 | 平台特点 |
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引物存储
形式 | 推荐温度 | 说明 |
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冻干粉 | -20°C(可放冰箱冷冻室) | 室温下短期(几周)没问题,但长期需低温保存 |
溶液形式 | -20°C(长期)或 4°C(短期使用) | 避免频繁冻融 |
溶剂 | 稳定性 | 说明 |
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无RNA酶无菌水(ddH₂O) | 稳定性中等 | 易受pH波动或杂质影响,不推荐长期存放 |
TE缓冲液(10 mM Tris, 1 mM EDTA, pH 8.0) | 最佳选择 | Tris缓冲pH,EDTA螯合金属抑制核酸酶,但它可能影响某些酶反应(如酶切) |
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溶液状态下的引物更容易降解,分装后存储。一次性配成多个小管(Aliquot),每管仅包含1~2周使用量。工作浓度一般为10 微摩尔/升(10 μmol/L)。高频使用(如qPCR),可把部分溶液分装在 4°C 保存,几周内用完。
-
避免反复冻融,避免阳光直射,避免长时间室温放置:
储存条件 | 推荐保存时限 |
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冻干粉,-20°C | ≥ 2 年 |
溶液,-20°C | 1~2 年 |
溶液,4°C | ≤ 1 个月 |
溶液,室温 | 几小时以内(仅临时) |