转录组分析流程(七)：GSEA分析
我们的教程主要是以一个具体的例子作为线索，通过对公共数据库数据bulk-RNA-seq的挖掘，利用生物信息学分析来探索目标基因集作为某种疾病数据预后基因的潜能及其潜在分子机制，同时在单细胞水平分析(对scRNA-seq进行挖掘)预后基因的表达，了解细胞之间的通讯网络，以期为该疾病临床治疗提供新的参考，同时我们还可以经过分子对接实现药物靶点的初步筛选。
文章目录
- 一、背景
- 1.GSEA
- 基本概念
- 实例代码
- 结果解释
- 注意事项
- 2.GSVA
- 基本概念
- 实例代码
- 结果解释
- 注意事项
- 二、GSEA+GSVA富集分析实战
- 1.GSVA分析
- 2.GSEA分析
一、背景
1.GSEA
基本概念
基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis, GSEA）是一种常用的功能基因组学分析方法，能够评估预定义基