AlphaFold3安装报错
ModuleNotFoundError: No module named 'alphafold3.cpp'
- 运行python build_data.py 报错😭
- 解决办法
- 运行解决办法的时候报错ERROR: Failed to build installable wheels for some pyproject.toml based projects (alphafold3)
- 解决办法
- AlphaFold3安装
运行python build_data.py 报错😭
报错原因，alphafold3的环境中缺少cpp文件，需要将alphafold3的cpp文件编译进使用的conda环境中。
解决办法
运行下面命令将alphafold3编译
pip install . --no-deps --verbose
完成编译后再次运行’pip install . --no-deps --verbose’就可以啦！
运行解决办法的时候报错ERROR: Failed to build installable wheels for some pyproject.toml based projects (alphafold3)
完整报错如下
该错误表明构建过程在 CMake 配置步骤中失败，这是编译 AlphaFold3 原生扩展的关键部分。
解决办法
- AlphaFold3 需要 CMake 来编译 C++ 组件。确保已经安装并且符合运行版本
conda install -c conda-forge cmake make
- AlphaFold3 需要 CUDA 来进行 GPU 加速。验证已经安装完成：
nvcc --version # Check CUDA
cat /usr/local/cuda/version.txt # Alternative CUDA check
- 如果步骤2中缺少安装包可以运行如下命令进行安装
conda install -c nvidia cuda-toolkit
完成上述的命令后再运行’pip install . --no-deps --verbose’一般就可以成功编译AlphaFold3啦！
- 需要运行build_data
AlphaFold3安装
另外加一个alphafold的安装教程。可以参考进行安装。